メールアドレス欄には会社のメールアドレスと自宅（個人）のメールアドレスのどちらを入力したほうが良いですか。

登録はどちらでも構いません。

登録されたメールアドレスには、企業からのメッセージをお知らせする『お知らせメール』や求人情報をお届けする『メールマガジン』などが届きます。メールで情報をいち早く把握することができる為、頻繁に使うメールアドレスを登録したほうが便利です。

頻繁に使うといった面では、会社のメールアドレスが適しているといえますが、会社側に転職活動を行っていることを知られたくない場合は、自宅（個人）のメールアドレスを登録するのが良いでしょう。